百度浏览器的小说阅读模式本身并不直接提供过滤弹窗广告的功能。不过，你可以通过以下方法来尝试减少在阅读过程中遇到的弹窗广告：
1. 使用广告拦截插件：安装一个广告拦截插件（如adguard、ublock origin等）可以帮助你屏蔽掉一些不必要的弹窗广告。这些插件通常可以自动检测并阻止广告，但请注意，它们可能会影响网页的正常显示或导致某些网站无法加载。
2. 调整浏览器设置：在浏览器的设置中，你可以找到相关的广告拦截选项，关闭或禁用那些你认为是广告的弹窗。
3. 使用无痕浏览模式：如果你不想留下任何浏览记录，可以尝试使用无痕浏览模式。这样，你的浏览历史和cookies都会被清除，从而减少被广告打扰的机会。
4. 更新浏览器和操作系统：确保你的浏览器和操作系统都是最新版本，因为新版本通常会修复一些广告问题。
5. 检查浏览器扩展：有时候，一些浏览器扩展可能会意外地添加广告到你的浏览体验中。确保你安装了所有扩展，并且没有不小心安装了一些不必要的扩展。
6. 手动检查：在阅读小说时，如果遇到弹窗广告，可以尝试手动关闭它。这需要你有一定的耐心和细心，因为不是所有的广告都能立即识别出来。
总之，虽然上述方法可以帮助你减少在阅读过程中遇到的弹窗广告，但完全避免广告是不可能的。因此，在使用这些方法的同时，也要保持一定的耐心和理解。